DNA / EPIGENOMICA

RRBSeq


L’RRBS è un’analisi della metilazione del DNA sull’intero genoma, che sequenzia solo un campione ridotto e rappresentativo dell’intero genoma, riducendo notevolmente I costi del sequenziamento.

L’approccio RRBS prevede l’arricchimento del promotore e delle regioni insulari CpG mediante scissione enzimatica (Msp I), combinato con il sequenziamento del bisolfito permette di ottenere informazioni quantitative sulla metilazione del DNA a livello di genoma con risoluzione a base singola.

Questo metodo consente l’identificazione più accurata della 5-metilcitosina (5mC) per NGS e l’interrogazione della 5-idrossimetilcitosina (5hmC), una base modificata che non viene analizzata mediante i tradizionali approcci di conversione del bisolfito.