L’ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin) seguito dal sequenziamento NGS, è una tecnologia chiave per la mappatura del genoma della cromatina accessibile. Questa tecnologia utilizza la trasposasi Tn5, che taglia la cromatina aperta esposta e lega contemporaneamente gli adattatori per la successiva amplificazione e sequenziamento.
È possibile con questo approccio ottenere informazioni sulla regolazione genica e comprendere le parti aperte della cromatina, determinare le posizioni dei nucleosomi alla risoluzione di un singolo nucleotide, identificare le regioni occupate dai fattori di trascrizione.
A seconda dell’obiettivo del progetto, è possibile scegliere la strategia più efficace. Approccio bulk o contattaci e discuteremo la tua configurazione sperimentale con uno dei nostri esperti.