Cleavage Under Targets and Tagmentation è una tecnica avanzata di sequenziamento del DNA utilizzata per mappare le interazioni tra proteine e DNA, in particolare per identificare i siti di legame delle proteine regolatrici come i fattori di trascrizione o le modifiche degli istoni.
È una tecnica potente ed efficiente che combina la specificità del legame anticorpale con la precisione del taglio enzimatica e la successiva amplificazione e sequenziamento del DNA. Ha una alta specificità e sensibilità in quanto utilizza anticorpi specifici e la transposasi Tn5 per ottenere una mappatura precisa delle interazioni proteina-DNA.
Richiede un numero relativamente basso di cellule rispetto ad altre tecniche simili, come ChIP-seq.
Tale approccio viene utilizzato per identificare i siti di legame dei fattori di trascrizione e delle modifiche istoniche per comprendere la regolazione dell’espressione genica; per mappare le modifiche istoniche al fine di studiare i cambiamenti epigenetici in diverse condizioni biologiche o malattie; per analizzare le alterazioni nelle interazioni proteina-DNA nei tumori per identificare potenziali target terapeutici.