La metatrascrittomica è una tecnica avanzata utilizzata per studiare l’espressione genica di intere comunità microbiche in un determinato ambiente. A differenza della metagenomica, che analizza il DNA totale di una comunità microbica per identificare i geni presenti, la metatrascrittomica si focalizza sull’RNA totale per comprendere quali geni sono effettivamente espressi in un dato momento e contesto.
Nello specifico si analizzano i profili di espressione genica delle comunità microbiche allo scopo di fornire una visione dinamica delle funzioni microbiche in un ambiente specifico, permettere di studiare le risposte microbiche a stimoli ambientali, come cambiamenti di temperatura, nutrienti, presenza di inquinanti, aiutare a identificare i ruoli ecologici dei diversi microbi nelle loro comunità.