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HI_C

La Hi-C (High Chromosome Conformation Capture) è un’indagine onnicomprensiva dei vari tipi di interazioni tra le anse cromatiche. Questo metodo permette di analizzare l’organizzazione spaziale del genoma e mappare il ripiegamento cromosomico di ordine superiore e i domini topologici associati (TAD). L’analisi dell’organizzazione spaziale della cromatina evidenzia le reti regolatorie che governano programmi trascrizionali che potrebbero avere un ruolo critico in condizioni fisiologiche e patologiche. 

L’analisi dei dati Hi-C non solo rivela la struttura genomica complessiva dei cromosomi dei mammiferi, ma offre anche approfondimenti sulle proprietà biofisiche della cromatina nonché contatti più specifici e a lungo raggio tra elementi genomici distanti (ad esempio tra geni ed elementi regolatori. Infatti attraverso questo metodo si produce una mappa Hi-C, ossia una libreria di sequencing su scala genomica che permette la misura delle distanze 3D tra tutte le coppie possibili di loci del genoma.