DNA

WGBS

Il sequenziamento con bisolfito dell’intero genoma (WGBS) è un protocollo consolidato per rilevare le citosine metilate nel DNA genomico. In questo metodo, il DNA genomico viene trattato con bisolfito di sodio e quindi sequenziato, fornendo una risoluzione a base singola delle citosine metilate nel genoma. Dopo il trattamento con bisolfito, le citosine non metilate vengono deaminate in uracili che, dopo il sequenziamento, vengono convertiti in timidine.

Allo stesso tempo, le citosine metilate resistono alla deaminazione e vengono lette come citosine. La posizione delle citosine metilate può quindi essere determinata confrontando sequenze trattate e non trattate. 

La metilazione della citosina può modificare significativamente l’espressione genica temporale e spaziale e il rimodellamento della cromatina. Vantaggio di questo approccio è sicuramente la valutazione della metilazione praticamente in ogni citosina del genoma nella maggior parte delle specie.