DNA / MICROARRAY

GENOTIPIZZAZIONE

Microarray

Genomix4life fornisce una vasta gamma di servizi di microarray utilizzando piattaforme Illumina.

La tecnologia microarray Illumina (nota anche come tecnologia BeadArray) utilizza microsfere di silice. Sulla superficie di ciascun array, o BeadChip, è possibile analizzare contemporaneamente da centinaia di migliaia a milioni di genotipi per un singolo individuo. Queste minuscole sfere di silice sono alloggiate in micropozzetti accuratamente incisi e rivestiti con copie multiple di una sonda oligonucleotidica mirata a un locus specifico nel genoma. Quando i frammenti di DNA passano sul BeadChip, ciascuna sonda si lega a una sequenza complementare nel DNA del campione, fermando una base prima del locus di interesse. La specificità allelica è conferita da un’estensione di base singola che incorpora uno dei quattro nucleotidi marcati.La tecnologia Infinium produce qualità dei dati e velocità di chiamata eccezionali, nonché una riproducibilità costante. Offriamo un’ampia gamma di opzioni di microarray basate sulla complessità dell’SNP e sulla produttività del campione. 

Infinium Global Screening Array-24

Questo array di genotipizzazione di nuova generazione fornisce una soluzione scalabile ed economicamente vantaggiosa per la genetica delle popolazioni, gli studi di farmacogenomica e la ricerca sulla medicina di precisione. Il contenuto del BeadChip comprende circa 654.027 marcatori fissi con possibilità di aggiungere marcatori personalizzati fino a 100.000. 

Infinium OmniExpress-24

Questo array offre una produttività eccezionale di migliaia di campioni a settimana, consentendo potenti studi di associazione sull’intero genoma umano (GWAS). Contiene circa 720 marcatori fissi con possibilità di aggiungere marcatori personalizzati fino a 30.000

Infinium Omni2.5

Questo array BeadChip presenta circa 2,4 milioni di marcatori e offre una copertura completa e contenuto esonico funzionale per la genotipizzazione di nuova generazione, GWAS e analisi CNV.

Infinium Omni5

Questo array BeadChip è ottimizzato per la genotipizzazione dell’intero genoma e per gli studi CNV, copre > 4,3 milioni di varianti dell’intero genoma fino all’1% della frequenza allelica minore (MAF), oltre a nuove varianti esoniche funzionali.

Infinium CytoSNP-850K v1.4 BeadChip

Fornisce una copertura focalizzata su 3262 geni malattia di nota rilevanza citogenetica in applicazioni sia costituzionali che tumorali. Il contenuto del BeadChip comprende circa 850.000 marcatori di varianti selezionati che abbracciano il genoma con copertura supplementare per applicazioni citogenetiche.

Analisi di metilazione del DNA

Il BeadChip Infinium MethylationEPIC v2.0 è uno strumento di screening della metilazione dell’intero genoma che presenta oltre 935.000 marcatori di siti CpG nelle regioni biologicamente più significative del metiloma umano. Diversi tipi di campioni di DNA, compresi quelli isolati da FFPE, possono essere analizzati utilizzando questo approccio. La tecnologia MethylationEPIC v2.0 arry è utilizzata nella ricerca scientifica per comprendere meglio le modifiche epigenetiche nel DNA e le loro implicazioni nelle malattie e nello sviluppo biologico.

Altre specie

Beadchip personalizzabili Infinium HTS iSelect

È possibile personalizzare un beadchip in base alla specie di riferimento. Fino a 700.000 marcatori e per le principali specie. (pomodoro, criceto, gamberetto, equino, riso, pollo, soia, mais, ovino, canino, suino, drosophila, pesce zebra, nematode, lievito, pianta, bovino, mammifero, batteri, ratto, topo, virus).

È richiesto un numero di campioni minimo che varia in base alla specie.