Tecnologie

Il Centro è dotato di strumentazione d’avanguardia per studi strutturali e funzionali mediante analisi in grande scala di genomi, epigenomi, trascrittomi e metagenomi.

Sequenziamento con tecnologie short-e long-reads

La core facility dispone di diverse tecnologie di sequenziamento di nuova generazione per determinare l’ordine preciso delle basi del DNA.
Le tecnologie short-read producono sequenze di breve durata tra cui Illumina (NovaSeq6000, MiSeq e MiSeq Dx, NextSeq 550 Sequencing System) e Thermo Fisher (Genexus).
Le tecnologie long-read producono sequenze più lunghe con una maggiore accuratezza tra cui Oxford Nanopore Technologies (GridION). Questi sequenziatori sono supportati da sistemi automatizzati per la preparazione di librerie ad alta processività (MagEx e NGS STAR, Hamilton).

Single cell profiling

La core facility di “Single Cell Profiling” utilizza tecnologie per analizzare singole cellule, permettendo una comprensione più dettagliata della biologia cellulare e della funzione genetica. Il laboratorio dispone delle più avanzate tecnologie per studi di genomica (DNA, RNA e epigenoma) a singola cellula e di trascrittomica spaziale, come:
Chromium di 10X Genomics, SMARTer ICELL8 cx Single Cell di Takara, Tapestri di MissionBio e GeoMx Digital Spatial Profiler e nCounter® Analysis Systems di Nanostring.
Il laboratorio dispone anche di tecnologie per la separazione e sorting di cellule per sequenziamento, tra cui un BD FACSMelody™, un citofluorimetro separatore, (SONY MA900) basato su chip micro-fluidici ed avanzata automazione che semplifica il sorting cellulare, un sistema (LeviCell – LevitasBIO) in grado di separare un ampio spettro di tipi di campioni grazie alle proprietà del loro campo magnetico e una tecnologia innovativa (DEPArray) che permette di identificare e separare le cellule con precisione, utilizzando immagini ad alta risoluzione in fluorescenza e in campo chiaro.

Microarray

I servizi di microarray rappresentano un grande passo avanti nell’analisi genomica, consentendo ai ricercatori di esplorare ampie variazioni genetiche e modifiche epigenetiche. Attraverso questa tecnologia è possibile effettuare analisi di genotipizzazione basati su un’ ampia gamma di varianti genetiche, da migliaia a milioni, in un unico esperimento.
Sfruttiamo le tecnologie più recenti per offrire approfondimenti completi e all’avanguardia, in sede è presente la tecnologia iScan di Illumina, che grazie alla sua elevata risoluzione e capacità di throughput, consente di analizzare milioni di varianti genetiche o migliaia di campioni in un’unica corsa.

Altre tecnologie

Il centro è dotato di un’ampia gamma di tecnologie avanzate e strumentazioni a supporto della genomica e della bioinformatica, progettate per fornire un supporto completo e integrato in questi ambiti. Grazie a infrastrutture all’avanguardia, sistemi automatizzati per l’analisi dei dati genomici siamo in grado di offrire soluzioni personalizzate e di alta precisione. Il nostro approccio a 360 gradi garantisce che ogni fase del processo, dalla raccolta dei dati alla loro interpretazione, sia gestita con la massima efficienza e accuratezza.