Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease è una tecnica avanzata per lo studio delle interazioni tra proteine e DNA, simile a CUT&TAG, ma con alcune differenze chiave. È utilizzata per identificare i siti di legame delle proteine regolatrici come i fattori di trascrizione o le modifiche degli istoni sul genoma. Ha alta specificità e sensibilità in quanto utilizza anticorpi specifici e la MNase per ottenere una mappatura precisa delle interazioni proteina-DNA.
Richiede un numero relativamente basso di cellule ed è caratterizzata da una ridotta frammentazione aspecifica poiché la MNase è attivata solo in prossimità dei siti di legame delle proteine target riducendo la frammentazione del DNA non specifico.
CUT&RUN seq rappresenta un potente strumento nella ricerca genomica ed epigenetica, offrendo una visione dettagliata delle interazioni tra proteine e DNA con elevata precisione ed efficienza.
Entrambe le tecniche sono strumenti potenti per la mappatura delle interazioni proteina-DNA, con CUT&RUN che offre vantaggi in termini di specificità del taglio e CUT&TAG che semplifica la preparazione della libreria di sequenziamento. La scelta tra le due dipende spesso dalle specifiche esigenze sperimentali e dalle risorse disponibili. Scrivici per informazioni