Genomix4Life S.r.l. fornisce servizi di sequenziamento di nuova generazione utilizzando diverse piattaforme high-throughput come HiSeq2500, MiSeq, NextSeq 500 (Illumina) e Ion Torrent PGM (Life Technologies). Questi sequenziatori di nuova generazione consentono di produrre milioni di sequenze di DNA in pochi giorni, rendendo possibili studi di genomica a costi accessibili.
Le tecnologie di nuova generazione sono utilizzate per differenti tipi di analisi, come il sequenziamento dell'intero genoma e dell'esoma, l'analisi del profilo di espressione genico e l'identificazione di trascritti alternativi, l'individuazione di lncRNAs, miRNA e altri piccoli RNA non codificanti e sono adatte per studi di metilazione del DNA e di interazione DNA-proteina.
Genomix4Life offre una vasta gamma di applicazioni di genomica.
Sequenziatori
Illumina Nextseq 500
Il sequenziatore NextSeq 500 rappresenta la soluzione più flessibile e semplice per una vasta gamma di applicazioni. I dati sono generati in 12 ore per le corse da 75 cicli e in meno di 30 ore per le corse da 300 cicli, garantendo tempi brevi e massima efficienza.
Illumina Hiseq 2500
Il sequenziatore HiSeq 2500 è il primo sistema Illumina che consente due modalità di sequenziamento (100bp paired-end reads in una corsa standard e 250bp paired-end reads per una corsa rapida) su una o due flowcells contemporaneamente, permettendo una flessibilità e una scalabilità adatta allo studio dei genomi. Permette di ottenere molteplici GB di dati provenienti da diversi milioni di templati (150Gb su corsa rapida e 300Gb su una singola corsa).
Illumina MiSeq
Sequenziatore consigliato per piccoli progetti, può produrre sequenze
fino a 300 nt di lunghezza, e consente di generare fino a 15 GB di dati in
una corsa di 2 x 300 paired-end.
Life technologies Ion Torrent PGM
Piattaforma di sequenziamento ideale come alternativa per il
sequenziamento di genomi di piccole dimensioni o regioni mirate di
genomi più grandi. Ion Torrent è in grado di sequenziare
da 400.000 a 6.000.000 di reads in 2-4 ore.
Microarray
BeadXpress Illumina
Piattaforma per la genotipizzazione del DNA che consente l'analisi simultanea di un
massimo di 384 SNPs per ogni campione utilizzando la tecnologia VeraCode,
che sfrutta cilindri di vetro olograficamente incisi.
Questa tecnologia è ideale per studi di genotipizzazione
su larga scala e diagnostica in vitro.
iScan Illumina
iScan utilizza laser, sistema ottico e sistema di rilevazione
ad alte prestazioni e consente scansioni rapide senza sacrificare la qualità
e la riproducibilità dei dati. Grazie all’elevata sensibilità
e un basso limite di rilevazione, questo sistema produce dati di eccezionale qualità.
Altri strumenti
Bioruptor NGS
Questa tecnologia rappresenta un approccio ottimale per la frammentazione
del DNA richiesta per la preparazione delle librerie, fornisce
una buona resa del campione sia per quanto riguarda le dimensioni
del frammento che la riproducibilità, parametri essenziali
per i campioni da processare con sequenziamento di nuova generazione.
Real time PCR Agilent Mx3005P
Dopo un approccio genome-wide è necessario validare con un'altra tecnologia
i geni candidati che hanno mostrato un’espressione differenziale.
Genomix4Life offre la possibilità di effettuare tale convalida mediante PCR realtime quantitativa.
Nanodrop 2000c
Il controllo di qualità degli acidi nucleici è effettuato
mediante analisi spettrofotometrica usando il Nanodrop 2000
che permette di determinare i rapporti 260/280 e 260/230 con solo 1ul di campione.
Fluorimetro Qubit 2.0
Il Qubit è un fluorimetro che consente la quantificazione dei campioni
di RNA e DNA in modo accurato, utilizzando fluorofori specifici per l'RNA e per il DNA.
Bioanalyzer Agilent 2100 e 4200 TapeStation
Questi sistemi permettono di valutare le dimensioni, la qualità e la quantità degli acidi nucleici, utilizzando la tecnologia basata sulla microfluidica per analizzare i profili di RNA e DNA fino a 60kb. Vengono utilizzati per verificare l'integrità dei campioni di RNA e DNA per il controllo di qualità delle librerie per il sequenziamento.
